お父様のご帰幽、心からお悔やみ申し上げます。
また、お問い合わせの初詣ですが、
50日を「忌明け」とし、神棚のおまつりも再開します。
ですので、初詣の参拝は宜しいですし、お神札やお守りを受けられるのは問題ないかとと存じます。
よく「鳥居をくぐらなければ…」というお話も聞きますが、特に意味はないように思います。
また、初詣期間は境内は賑やかですので、例えば2月頃皆さんでお参りされても宜しいかと存じます。